日本全国共有医学科82所，其中国立大学42所，公立大学8所，私立大学31所。根据设立时间，医学科分为4类公立大学和3类私立大学。
注意：大学不分先后，日本医学部为6年，并非所有学校皆可招收留学生，具体信息请至各大学官网募集要项查看。
国公立大学
从幕末到明治时代，各地设立的医学所中，神田的种痘馆后来成为官营“医学所”，后来成为东京大学医学部。之后，在东大医学部的医生指导的形式下，从明治到昭和，在全国的重要地方设立了7所帝国大学，目前这些大学被称为旧帝国大学。
北海道大学・東北大学・東京大学・名古屋大学・京都大学・大阪大学・九州大学
1919年大学法令的实施，批准了6所医科大学。同年，现在的京都府立医科大学也升格为医科大学。在国立公立大学中是继旧帝大学之后历史悠久的大学集团。
【国立】 千葉大学・新潟大学・金沢大学・岡山大学・長崎大学・熊本大学
【公立】 京都府立医科大学
进入20世纪30年代，因医生不足，政府在全国19所大学新增设了医学专业。
【公立】 札幌医科大学・福島県立医科大学・横浜市立大学・名古屋市立大学・大阪市立大学・奈良県立医科大学・和歌山県立医科大学
1970年前后，因医疗上的地区差距，日本提出了“一个县一个医科大学”的构想，因此新成立了18个医学专业和医科大学。
注：都道府县都是日本的一级行政区，都是广域型行政区，都是类似于省的行政单位。
【国立】 旭川医科大学・秋田大学・山形大学・筑波大学・富山大学・福井大学・山梨大学・浜松医科大学・滋賀医科大学・島根大学・香川大学・愛媛大学・高知大学・佐賀大学・大分大学・宮崎大学・琉球大学
【大学校】 防衛医科大学 ※文部省所管外的大学
国公立大学医学部学费
【国立大学】入学金282，000日元，每年学费535，800日元是标准金额。另外，千叶大学和东京医科齿科大学从2020年4月入学者开始，每年的学费为642，960日元。
【公立大学】根据入学金、住名、年学费因大学不同而费用不同。
私立大学
1、私立御三家（3所大学）
当时，对于重视研究和教育的国立公立大学，以重视临床的方针出生的是私立大学医学科。其医学部与公立的旧制医科大学有着同样的历史，入学难度也很高，被称为“私立御三家”。
2、旧医専（10所大学）
旧医専是继御三家之后的形式成为大学的，其前身为医学专门学校。日本大学的专门部医学系于1942年升格为旧制大学医学系。
岩手医科大学・順天堂大学・昭和大学・東京医科大学・東京女子医科大学・東邦大学・日本大学・大阪医科大学・関西医科大学・久留米大学
3、1970年代新設医科大学（16所大学）
私立大学在1970年代在全国各地新建了16所医学科和医科大学。也有以私人医院和专门学校为母体的情况。自治医科大学是全国都道府县共同成立的一所大学。
自治医科大学・獨協医科大学・埼玉医科大学・北里大学・杏林大学・帝京大学・東海大学・聖マリアンナ医科大学・金沢医科大学・愛知医科大学・藤田医科大学・近畿大学・兵庫医科大学・川崎医科大学・福岡大学・産業医科大学
4、2016年新設医科大学（1所大学）
東北医科薬科大学
5、2017年新設医科大学（1所大学）
国際医療福祉大学
私立大学医学部学费
私立大学学费比国公立大学学费偏贵，以下是根据2020年度招生要点(含部分网页)中公布的学费估算得出的“六年总费用”。
（以下顺位是从低到高进行的排序（部分），其余私立大学医学部学费私信老师了解）
| 1 | 国際医療福祉大学 | 19,100,000 |
| 2 | 順天堂大学 | 20,800,000 |
| 3 | 慶應義塾大学 | 22,059,600 |
| 4 | 日本医科大学 | 22,297,800 |
| 5 | 自治医科大学 | 22,600,000 |
| 6 | 東京慈恵会医科大学 | 22,810,000 |
| 7 | 東邦大学 | 26,297,800 |
| 8 | 関西医科大学 | 28,140,000 |
| 9 | 昭和大学 | 28,172,000 |
| 10 | 東京医科大学 | 29,833,700 |
此外，日本各大学医学部的入学考试难易度用偏差值表示。以下是部分大学医学部2020年偏差值，更多完整信息，请咨询老师。
