学费不同
EMBA是工商管理硕士，针对的是企业高管，不需要全国联考，毕业只有学位(即EMBA学位)，学费较贵，长江商学院上课通常是一个月选择四天连续上，将某一科目上完。俗称“模块化”教学。
MBA是工商管理硕士，报考的人有的是企业中层领导，或基层管理者，也有未当管理者的普通职员。要参加长江商学院全国MBA联考(考综合和英语两大科)，毕业后有学位(MBA学位证书)，也有的还有毕业证(研究生毕业证书)，学费在7-12万元之间。一般班(需要辞职后脱产学习)和班两种。上课按大学的正常教学安排相一致，通常是9月开学，7月毕业。(有些班是1月份毕业。)
培养目标不同
EMBA教育培养的是目前已担任职务的管理人员，而MBA(工商管理硕士)教育培养的是未来的管理人员。
招收对象不同
EMBA特别适合于那些实际管理经验丰富但离开应试环境多年的企业和政府高层人士。而长江商学院MBA适合刚刚走上管理工作岗位两三年，有志于从事管理工作的人士。
师资及教学模式不同
长江商学院EMBA课程全部由海内外知名学者、教授任教或答疑。长江商学院教学上更注重在启发的基础上，将课程与学员实际体验相结合，偏重实际运用和可操作性,更适合正在商场实战的高层管理者。
MBA课程多为国内本校师资任教，长江商学院多采用“讲授+案例分析+团队讨论”的教学方式，在理论层面探讨较多,对培养未来的管理者较为适合。
入学考试不同
在国外，如要就读MBA需参加GMAT入学考试。但就读EMBA只有71%的学校要求GMAT成绩，平均过线分数为530分，而海外学生只需要托福550分成绩即可。但这并不是说，EMBA入学非常容易，长江商学院学校更看中的是学员的工作经验、工作能力、的信和面试结果。
就读人员不同
长江商学院由于MBA入学考试需要考外语、数学，这就给那些管理经验丰富但离开应试环境多年的企业高层设置了门槛。目前国内MBA正出现低龄化现象，考分高的往往是那些大学毕业3年左右、应试能力强的年轻人。而EMBA入学笔试、面试均由培养单位自行组织，门槛大为降低。当然，这并不等于说，只要是老板、老总就可以读EMBA。就曾将一名愿出25万美元就读，但不符条件的老板拒之门外。规定，具有本科以上学历，8年以上工作经历(其中4年以上管理工作经历)，较大规模企业的现职高层管理人员才可报名。
