随着新企业所得税的实施，一系列配套的法律法规相继出台，为指导和规范高新技术企业收入的核算及符合规定的研究开发费用的归集，专业技术委员会特制订本指引。
一、收入成本核算的指引
1、收入账户的设置：除原有的科目外，应设置“高新技术产品销售收入”、“技术转让收入”、“技术承包收入”、“技术服务收入”、“接受委托科研收入”五个二级科目，分别用于核算符合《重点支持的高新技术领域》中规定的各项收入。至于上述五个二级科目应设置在主营业务收入还是其他业务收入总账科目下，应根据企业营业情况而定，企业以商品销售收入为主的，其科目设置如下：主营业务收入--“高新技术产品销售收入”，其他的二级科目在其他业务收入中核算，反之亦然。《重点支持的高新技术领域》中规定的各项收入以外的各项收入按原来规定执行。
2、成本账户的设置：除原有的科目外，应设置“高新技术产品销售成本”、“技术转让成本”、“技术承包成本”、“技术服务成本”、“接受委托科研成本”五个二级科目，分别用于核算符合《重点支持的高新技术领域》中规定的各项成本。至于上述五个二级科目应设置在主营业务成本还是其他业务成本总账科目下，应根据企业营业情况而定，企业以商品销售成本为主的，其科目设置如下：主营业务成本--“高新技术产品销售成本”，其他的二级科目在其他业务成本中核算，反之亦然。《重点支持的高新技术领域》中规定的各项成本以外的各项成本按原来规定执行。
二、研究开发费用的核算指引
1、研究开发费用的归集：研究开发费用的归集应启用“成本类”中的“研发支出”科目进行过渡性核算。研究开发费用应分为资本化支出和费用化支出，按立项书上的项目设置“研发支出—XX资本化支出”和“研发支出—XX费用化支出”二级科目。二级科目下分别设置“材料”、“燃料”、“动力费用”、“工资”、“津贴、补贴”、“奖金”、“仪器折旧费”、“设备折旧费”、“仪器租赁费”、“设备租赁费”、“办公场地租赁费”、“软件摊销费”、“专利权摊销”、“非专利技术摊销”、“模具、工艺设备开发及制造费”、“研发成果论证、鉴定、评审、验收费用”、“新产品设计费”、“新工艺规程制定费”、“技术图书资料费”、“资料翻译费”、“其他”三级科目对发生的费用进行核算。
2、期末(月末)的账务处理：期末(月末)将“研发支出--费用化支出”科目发生额结转到“管理费用—研发费用”科目，资本化支出待该资产达到预定用途时将所发生的支出“研发支出--资本化支出”转入相关资产成本。
